胃癌是一种常见的恶性肿瘤，早期诊断和治疗是提高患者生存率的关键。然而，目前临床上使用的肿瘤标志物大多是糖蛋白质，其糖基化的变化与胃癌的发生发展有着密切的联系，但是还没有能够准确反映特定蛋白质、特定位点上的特定糖型的标志物，这些糖型被称为位点特异性糖型，它们可能是更敏感和特异的胃癌诊断指标。
为了解决这一难题，中国科学院大连化学物理研究所的叶明亮研究员团队和空军军医大学的聂勇战教授团队等合作，开发出了一种高稳健的位点特异性糖型蛋白质组学分析系统，可以从生物样本中富集和检测 N-完整糖肽，即带有完整糖链的 N-糖基化肽段，并利用自主开发的软件鉴定和定量位点特异性糖型。该系统具有高灵敏、高稳健、高通量的特点，可以规模化地分析 N-糖基化蛋白质组，为发现新型的糖基化类生物标志物提供了一个有力的工具。
利用该系统，研究人员分析了 278 例临床样本的 N-糖基化蛋白质组，包括正常人、胃炎、胃溃疡和胃癌患者的血清样本，筛选并验证了 6 个新型的位点特异性糖型标志物，其中 4 个可以用于诊断胃癌，尤其是早期胃癌，其诊断效能优于目前临床上使用的胃癌标志物 CA72-4。这些标志物为胃癌的早期诊断和预后评估提供了新的候选指标，也为深入揭示胃癌的糖基化机制和发病原因提供了新的线索。
该研究成果近日发表在国际权威期刊《先进科学》上，为蛋白质糖基化的疾病标志物发现和临床应用开辟了新的途径，也展示了我国在蛋白质组学领域的创新能力和水平。
